報 告 人:丁曉東 教 授
報告題目:剪接因子SRRM1在提高植物耐鹽性的分子機理解析
報告時間:2023年6月22日15:00-17:00
報告地點:重點實驗室103室
主辦單位:生命科學(xué)學(xué)院、江蘇省藥食植物生物技術(shù)國家重點實驗室(培育)、科學(xué)技術(shù)研究院
報告人簡介:
丁曉東博士,東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授,博士生導(dǎo)師,學(xué)科帶頭人。先后在中國、日本和美國等多個國際知名的科研單位從事分子生物學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和基因表達調(diào)控等方面的研究,在PNAS、J Biol Chem、PlantJ、Plant Physiol、Plant CellEnviron等期刊上發(fā)表發(fā)表高水平學(xué)術(shù)論文40多篇。2016年全職回到東北農(nóng)業(yè)大學(xué)從事大豆和野生大豆的逆境生物學(xué)研究,主持多項國家自然科學(xué)基金和國家“十三五”科技部攻關(guān)項目。
報告摘要:
基因剪接(mRNA splicing)是生物為了適應(yīng)環(huán)境變化和生長發(fā)育所具有的基因表達調(diào)控機制之一。在擬南芥中,當(dāng)植物受到鹽堿脅迫時,剪接因子SRRM1能夠被SnRK1激酶所磷酸化,并被招募進入剪接體U1亞復(fù)合體中參與靶pre-mRNA的可變剪接(Alternative splicing)。通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)(RNA-seq)和RNA免疫沉淀組學(xué)(RNA-RIP)的研究,鑒定到一系列SRRM1的靶基因,并對其中的一個剪接頻率最高的NF-YA10基因做了進一步功能性研究,NF-YA10編碼一個核定位的轉(zhuǎn)錄因子。生物信息學(xué)、生物化學(xué)和生物物理學(xué)研究表明,SRRM1通過識別和結(jié)合NF-YA10 pre-mRNA的第一個內(nèi)含子的5’端參與對該基因的可變剪接。在snrk1突變體植物中,SRRM1上的相應(yīng)位點無法被SnRK1磷酸化,因此不能參與對NF-YA10基因的正確剪接,導(dǎo)致突變體植物對鹽堿脅迫敏感。